燃料電池の心臓部が、スタックと呼ばれる部分で、発電機の役割を果たしています。

スタックは、セルの集合体で構成されており、個々のセルは、セパレーターにＭＥＡ（発電の仕組み）がはさみ込まれるように構成されています。

個々のセルを構成するセパレーターは、流路が形成され、この部分を酸素（空気）、水素（水素リッチガス）が流れることで、ＭＥＡの燃料極、空気極に水素と酸素が供給され、電気的な変化を発生させ、発電が行われます。
なお、１枚のセルで発電できる容量は限られ、セルの枚数で発電される発電容量（定格）が決まってきます。

発電と同時に、水素イオン、電子、酸素が化合する段階で、熱を発生しますが、この熱を排熱として廃棄するのでなく、熱交換器により給湯タンク内の水を温め、給湯タンク内に、60℃以上のお湯として蓄えます。